アセンブリ作成時やアセンブリを外部保存(リンク付き)する操作を実行した場合に以下のメッセージが表示します。

エラー表示ではなくオプション設定の通知機能です。
外部リンク及び内部リンクコピーされている要素を別々のアセンブリに配置すると表示します。
オプション設定と操作
〔1〕 3D オプション - 全般 の [リンクしたシェイプ名が一致しない時は通知する] のチェックを入れます。

チェックが外れている場合は、冒頭のメッセージは表示されません。2つのうち選択されている設定が反映されます。
オプション設定の通知機能
[オプション] → [全般] → [ユーザーインターフェイス ]
☑リンクしたシェイプ名が一致しないときは通知する
〔2〕 開いているシーンに外部に保存されている要素を挿入または、シーン内の要素を外部リンク保存します。
〔3〕 外部保存されたパーツを TriBall で [リンクコピー] します。 ※シーンには 2つのリンクされたパーツが存在する状態
〔4〕 リンクされたパーツの一つを右クリックし、[パーツプロパティ] を開きます。
〔5〕 全般 - ユーザー名下の設定を [このパーツのみ] に設定します。 ユーザー名を変更します。
※もう片方のパーツは [すべてのリンク インスタンス] に設定します。
〔6〕 それぞれのパーツに対して、別々のアセンブリを作成します。
この時、[このパーツのみ] に設定したパーツを含むアセンブリ作成時に冒頭のメッセージが表示されます。
〔7〕 また [このパーツのみ] に設定したパーツを含むアセンブリを [パーツ/アセンブリとして外部保存] します。
この時も冒頭のメッセージが表示されます。
動作説明
・[リンクと同じであるため、インスタンスの"ユーザー名"を変更]:もう片方のパーツ名に変更されます。
・[インスタンスは現在の"ユーザー名"を保持してプロパティを”このパーツのみ”に設定]:変更したユーザー名を保持します。